透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上 …
2019年9月15日 · 非常强的氢键大多数是带电荷氢键，由图可见这种情况下静电和诱导作用共同起到关键性角色，而色散作用相对而言可以忽略不计。注意sapt方法给出的“诱导项”本质上体现的是电荷转移、极化、轨道相互作用。 3 亮点3：一种新的氢键分类
关于氢键距离范围问题 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化 …
2024年5月13日 · 分子内的氢键还可以简单判断，因为距离不会很大，但是分子间氢键就不好判断，h.....y距离多少Å可以认为是形成氢键，没找到文献说明呢，所以请教下各位老师，有相关文献可以推荐下吗？麻烦啦，谢谢。
求助：氢键受体的距离和氢键的距离 - 分子模拟 (Molecular …
2024年6月26日 · 一般来说，我们常说的氢键距离2.3-3.5埃是指重原子之间的距离，而不是氢到重原子的距离，以水为例o-h···o的总长约2.7埃，其中o-h共价键差不多1埃，剩余h···o差不多1.7埃。
怎么计算分子间氢键键能？ - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计 …
2020年1月9日 · 提主提到的含有33个原子的分子是否还能用电子密度ρ来计算氢键键能e。 我优化出的四乙基醋酸铵、甲醇、甲乙酮应该算“大分子”，那这样的话四乙基醋酸铵和甲醇或者甲乙酮之间的氢键键能能通过电子密度计算么。
计算分子内氢键键能的几种方法 - 量子化学 (Quantum Chemistry)
2019年11月23日 · 计算分子内氢键键能的几种方法Several methods for calculating energy of intramolecular hydrogen bonds文/Sobereva@北京科音First release: 2019-Nov-23 Last upda ...,计算化学公社
求助gmx hbond做氢键分析得到的氢键数量结果 - 分子模拟 …
2019年10月25日 · 下面的粗斜体字是使用gmx hbond做氢键分析得到的氢键数量结果。gromacs在判定氢键应该有两个标准，一个是氢键距离R<=0.35nm，另一个是角度alpha<=30°。请问一下，下面第二列和第三列分别是用哪个标准判断得出的氢键数？
如何解释氢键的本质？ - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化 …
2017年2月19日 · 4.氢键也是键，是把一堆原子放的足够近的产物，所以以分析化学键的方法分析氢键并没有什么不妥。 5.定量运算，那种咬文嚼字，捕风捉影的分析没有太多价值。 6.氢键不简单。
gromacs分析氢键的问题 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算 …
2016年10月11日 · 我的计算发现，随着时间的增加，氢键数量逐渐增多趋于平衡。-life命令，显示纵坐标数值（GMX无给出单位，可能是无量纲）随着时间却逐渐减小，趋于平衡至零附近。两幅图此消彼长的关系，-life命令说明氢键数目稳定之后，新出现氢键的几率在逐渐变小。
在vesta里面O与H之前存在虚线代表什么意思？ - 量子化学 …
2023年2月19日 · 2. 修改键，所以找 Bonds 3. 修改氢键，所以选择和氢键相关的原子，H, O 之类的，所以要点击相关的原子 4. 修改所谓的“化学键”，本质上是 “成键范围”，也就是 “原子间的距离”，所以要修改距离的数值大小 有了上述逻辑，就很好找
求助怎么计算每个水分子的氢键数 - 分子模拟 (Molecular …
2024年11月27日 · 各位老师好，我想要计算每个水分子上的氢键个数。体系纯spce水体系，体系中共2197个水分子，周期性边界条件。 我使用lammps跑的模拟，因为是周期性边界条件，用vmd计算的值偏低。所以用chimerax统计氢键个数，共找到14574个氢键。